Gisou van der Goot est responsable du Laboratoire de Biologie Cellulaire et Membranaire et co-fondatrice de l''Institut d''Infectiologie, à la Faculté des Sciences de la Vie de l''EPFL.
Depuis 2021, Prof. van der Goot est Vice-présidente pour la transformation responsable,
 moteur du changement de l'EPFL vers une culture inclusive et un campus durable.
De 2014 à 2020, Prof. van der Goot a occupé la fonction de Doyenne de cette même Faculté.
Avant sa nomination à l''EPFL, en 2006, elle était Cheffe de Groupe à la Faculté des Sciences de l''Université de Genève (UNIGE), puis Professeure Associée à la Faculté de Médecine.
Prof. van der Goot a d''abord obtenu un diplôme d''ingénieure de l''Ecole Centrale de Paris avant d''entamer une thèse en Biophysique Moléculaire au CEA de Saclay (Université de Paris VI), suivie d''un séjour postdoctoral au Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire (EMBL) à Heidelberg (Allemagne).
Différentes distinctions lui ont été décernées, dont, en 2001, le Prix ‘Young Investigator' de l''EMBO (Organisation européenne de Biologie Moléculaire), puis, en 2005, le soutien par le programme international du ‘Howard Hughes Medical Institute (HHMI, Etats-Unis); en 2009, elle a été la première femme à obtenir le Prix Marcel Benoist. La même année, elle est élue membre de l'EMBO.
Les domaines d''expertise de la Prof. van der Goot incluent les mécanismes moléculaires et cellulaires des toxines bactériennes, l''organisation des membranes (des mammifères) et la biologie des organelles.
Prof. van der Goot est membre du conseil scientifique de diverses organisations telles que le Fonds National Suisse de la Recherche Scientifique (FNS), le Conseil Suisse de la Science et de la Technologie (CSST) et le Conseil Européen de la Recherche (ERC).